La Comisión Estatal del Agua, informa que corresponde a los ayuntamientos el saneamiento de las aguas residuales de los servicios a su cargo, según lo determina el artículo 115 de la Constitución Política de los Estados Unidos Mexicanos y del artículo 79 de la Constitución local. De ahí entonces que la Comisión Estatal del Agua y Saneamiento, con decreto 21,804/LVII/06, dejó la función del saneamiento y se convirtió en Comisión Estatal del Agua de Jalisco (CEA).
 
CEA Jalisco es un Organismo Descentralizado del Gobierno del Estado con personalidad jurídica y patrimonio propios.
 
La Comisión Estatal del Agua de Jalisco es el organismo que coordina y planifica los usos del agua en la entidad con funciones de autoridad administrativa. La cual tiene su domicilio social en la capital del Estado y cuya creación, establecimiento y funcionamiento se regula por la Ley del Agua para el Estado de Jalisco y sus Municipios.