El objetivo general de esta dependencia es crear las condiciones propicias para impulsar, coordinar y coadyuvar al desarrollo regional a través de la Innovación y el desarrollo educativo, científico y tecnológico del Estado.

Misión

Promover, facilitar e impulsar la creación y la adopción de una cultura innovadora y competitiva.

Visión

Para el 2019 posicionar a Jalisco como el Estado más innovador y con el mayor índice de desarrollo tecnológico de México. 

Las acciones y actividades de este órgano de gobierno, están enfocadas a impulsar, fomentar, coordinar y coadyuvar en el desarrollo de las acciones públicas y privadas relacionadas con el avance de la ciencia y la tecnología en el Estado de Jalisco, mediante programas enfocados al desarrollo de la innovación en Jalisco, la vinculación de empresa-universidad, fomento al desarrollo de prototipos, difusión y divulgación de la ciencia, el fomento de la propiedad intelectual, de la industria de tecnologías de Información, microelectrónica, multimedia y aeroespacial en Jalisco.
Esta secretaría se postula como promotora entre la población de los requerimientos, avances y logros científicos, tanto estatales como nacionales; incentive la ciencia y la tecnología como desarrollo de inversiones estratégicas; promueva la adopción de medidas de simplificación, fomente la actividad científica; y formule y coordine el Programa de Ciencia, Tecnología e Innovación de Jalisco.